El Herbario de la Universidad de Caldas, FAUC, fue creado en 1954 en la entonces Facultad de Agronomía, es el número 028 del Registro Nacional de Colecciones del Ministerio del Medio Ambiente. Cuenta con 20.150 ejemplares, cuyas fechas de colecta van desde enero de 1920 hasta el presente; reúne 5.668 especies, de 1.626 géneros y 233 familias; representantes de Gimnospermas, Angiospermas, Pteridophytos, Musgos, Hongos y Líquenes

En 1985 fue socio fundador de la Asociación Colombiana de Herbarios, y han sido sus directores los profesores: Hernán Villegas Galarza (1954 – 1968); Ovidio Javela (1968 – 1973); Mélida Restrepo de Fraume (1973 – 1991); Luis Miguel Álvarez Mejía (1992 – a la fecha)

Tiene como visión la documentación de la flora del departamento de Caldas, para lo cual incrementa sus colecciones representativas del departamento, mediante el desarrollo de proyectos de investigación florística, lo mismo que con las colectas asociadas a los procesos de docencia. Presta también servicios de identificación de especies a diversos actores del ámbito regional y nacional, los cuales abarcan estudiantes de pregrado y postgrado, apoyo a procesos judiciales, comerciales y servicios a otras universidades y centros de investigación.

Se encuentra desarrollando una herramienta que permita incrementar la disponibilidad y facilitar el uso de la información del herbario mediante el empleo de medios electrónicos.

La sistematización incluye el registro fotográfico de los ejemplares y la información sobre aspectos como: familia, género, especie, determinador, colector y número de colecta, fecha y lugar de colección, altura sobre el nivel del mar, coordenadas geográficas e información etnobotánica.

Una vez desarrollada la base de datos se ha dado curso al proceso de virtualización del herbario, con lo cual se espera contar con medios de consulta remota, en donde la información escrita y fotográfica estará a disposición para consulta de los miembros de la Universidad y de todos los usuarios de Internet, es también este un medio para compartir información con todas las colecciones biológicas de referencia del planeta y los investigadores botánicos de todo el mundo.

Esta colección es también la base para llevar a cabo el diseño de las políticas y estrategias para el desarrollo de la botánica en nuestra Institución y en la región, con base en el conocimiento del estado actual de las colecciones y la definición de las prioridades de colecta.